Британская компания Basecamp Research официально запустила проект Trillion Gene Atlas — одну из самых масштабных инициатив в истории современной биологии. Цель проекта заключается в сборе и всестороннем анализе генетического материала более чем 100 миллионов ранее не изученных видов живых организмов. Реализация этой задачи позволит увеличить объем доступных человечеству знаний о генетическом разнообразии Земли примерно в 100 раз.
Проект объединил усилия ведущих технологических компаний: Anthropic, разработчика систем секвенирования Ultima Genomics, компании PacBio, а также при поддержке вычислительных мощностей Nvidia. По заявлению участников, синергия передовых методов секвенирования и возможностей искусственного интеллекта позволит выполнить колоссальный объем работы менее чем за два года. Для сравнения, без применения современных алгоритмов на подобные исследования потребовалось бы свыше двух десятилетий.
Биологический ИИ нового поколения
Ключевая цель инициативы — формирование фундаментально нового массива данных для обучения специализированных биологических ИИ-моделей. В настоящее время большинство подобных разработок ограничены использованием одних и тех же публичных баз данных с малым набором последовательностей. В Basecamp Research убеждены, что именно дефицит разнообразных данных является главным барьером для прогресса в этой области.
Компания уже представила семейство моделей EDEN, построенное на базе данных BaseData. В нее включено более 10 миллиардов ранее неизвестных науке генов, обнаруженных у миллиона новых видов. Первые результаты работы подтвердили гипотезу разработчиков: по мере увеличения биологического разнообразия в обучающей выборке, возможности ИИ растут опережающими темпами.
Согласно отчету компании, EDEN стала первой системой, способной проектировать потенциальные терапевтические молекулы по описанию заболевания. В лабораторных условиях модель показала активность в человеческих Т-клетках без предварительного обучения на клинических данных. Также инженеры добились успеха в создании антимикробных пептидов с точностью попадания в патогены до 97% и развили технологию программируемой вставки генов AI-Programmable Gene Insertion (aiPGI).
Масштабы и технологическая база
Проект Trillion Gene Atlas значительно расширит охват исследований. За последние шесть лет Basecamp Research создала сеть партнерств в 31 стране, организовав сбор данных в регионах, которые ранее оставались «белыми пятнами» на карте биологической науки. Сейчас деятельность активно расширяется в Антарктиде, Чили и Аргентине.
Технологическим фундаментом стали системы сверхмассового секвенирования нового поколения. Ultima Genomics отвечает за высокопроизводительное чтение, а PacBio обеспечивает точность длинных последовательностей, что позволяет сохранять полный контекст генетического материала. Обработка этих данных ведется с помощью специализированных биоинформатических библиотек.
Партнерство с Anthropic направлено на интеграцию результатов проекта в возможности ИИ-ассистента Claude. Ожидается, что в будущем Claude сможет эффективно оперировать огромными массивами биологических данных, помогая ученым интерпретировать итоги экспериментов и радикально ускорять создание новых методов лечения.
Авторы инициативы проводят прямую параллель между Trillion Gene Atlas и проектом «Геном человека». Однако, если десятилетия назад наука концентрировалась на расшифровке кода одного вида, то сегодня ставится задача по созданию крупнейшей карты генетического разнообразия жизни. Это должно позволить медицине перейти от случайного поиска лекарств к систематическому проектированию препаратов по заданным параметрам с помощью нейросетей.
